研究著眼于病毒過去以預(yù)測未來的爆發(fā)

回顧過去可能有助于未來在人類對抗某些病毒時，特別是漢坦病毒的進化史。

Schuyler Liphardt，正在攻讀博士學(xué)位。在新墨西哥大學(xué)的生物學(xué)專業(yè)，是一個團隊的一部分，該團隊最近在北美發(fā)表了一篇名為“ 復(fù)雜歷史的復(fù)雜歷史的復(fù)雜歷史”的論文，該文章研究了北美地區(qū)的一種新發(fā)現(xiàn)的Soricid-Borne Orthohantavirus，探討了漢坦病毒的進化史。

Liphardt的背景是作為野外生物學(xué)家和乳房專家。他曾與哺乳動物西南生物學(xué)博物館合作七年。他的研究重點是漢坦病毒屬(Hantaviriade)的進化，其中正嗜華病毒是其中的一員。他使用系統(tǒng)發(fā)育學(xué)來研究物種或基因等生物實體之間的進化關(guān)系，以研究進化史。他的研究將他帶到阿拉斯加，巴拿馬，蒙古，和新墨西哥州，從野生哺乳動物身上采集樣本并對其進行篩選。

由于我們對漢坦病毒之間關(guān)系的了解最近有所進展，因此有必要重新命名某些群體，例如，由蝙蝠主持的漢坦病毒現(xiàn)在被稱為“mobatviruses”或“loanviruses”。“Soricid”指的是一種以昆蟲為食的小型哺乳動物。他解釋說，所有導(dǎo)致人們生病的漢坦病毒都被重新歸類為“鄰性病毒”。

“我用遺傳學(xué)來重建病毒的進化歷史，以及承載這種病毒的哺乳動物，”他解釋說，特別是蝙蝠，鼴鼠和sh .. 他研究了病毒從一個物種移動到另一個物種的歷史模式，以及它在移動時如何變化或進化。他說，對過去的了解可以幫助預(yù)測它將來如何發(fā)揮作用，并且隨著哺乳動物宿主隨著氣候變化而變化，我們可以預(yù)測疾病出現(xiàn)的 “熱點” 可能發(fā)生在哪里。

病毒的進化歷史很難研究。他解釋說，很多推斷生物進化歷史的途徑，如化石，都無法用于病毒。

“我們可以推斷出進化史的唯一方法是觀察生物相關(guān)病毒的存在，然后研究病毒本身的遺傳學(xué)......我的研究主要集中在其中的一部分 - 宿主歷史和生態(tài)學(xué)如何塑造當(dāng)前的病毒多樣性和分布 - 以漢坦病毒作為研究系統(tǒng)。這篇特定文章論述了單一病毒株Jemez Springs病毒如何在多物種宿主系統(tǒng)中傳播和進化。“

Liphardt的研究調(diào)查了所謂的漢坦病毒及其哺乳動物寄主的系統(tǒng)發(fā)育史，這些寄主在野外維持它們。系統(tǒng)地理學(xué)使用遺傳序列來推斷個體之間的關(guān)系，在這種情況下，分別是病毒和宿主物種，然后將這種多樣性映射到多個空間尺度。

結(jié)合對過去氣候和地質(zhì)歷史的了解，他和他的研究人員可以推斷出某些病毒和寄主物種如何以及何時達(dá)到今天的水平。

“然后我們可以比較病毒和宿主的這些不同的”關(guān)系樹“，并可以推斷病毒是否緊密跟蹤宿主并且或多或少地特定于某種宿主物種，或者病毒是否可以輕易地從宿主中跳出來物種接種物種，很容易適應(yīng)新宿主和增殖。病毒或任何病原體是否能夠輕易地在宿主之間跳躍對于管理或緩解疾病非常重要，“Liphardt指出。

“氣候變化不一定會在短期內(nèi)影響病毒或其宿主的潛在生物學(xué)，但會影響病毒的流行，病毒在整個地區(qū)的移動或病毒的維持。例如，Sin農(nóng)布雷病毒，漢坦病毒負(fù)責(zé)在90年代初期的四角地區(qū)漢坦病毒肺綜合征的暴發(fā)，是緊密相連的厄爾尼諾周期，” Liphardt說。

濕循環(huán)導(dǎo)致鹿鼠群的繁殖，這增加了感染的小鼠進入住所并感染HPS(漢坦病毒肺綜合征)的人的可能性。

“這是導(dǎo)致疾病流行率增加的臨時氣候事件的一個例子。在較長的規(guī)模上，隨著氣候變化減少了南部冬季的嚴(yán)重程度和時期，預(yù)計我們將在颶風(fēng)中重新出現(xiàn)瘧疾。以為例。這是因為氣候變化從根本上改變了當(dāng)?shù)丨h(huán)境，使其更有利于蚊子的某些物種生存。氣候變化正在改變?nèi)虻奈锓N范圍，擴大目前的范圍可能會發(fā)生疾病。“

Liphardt指出，這項工作是過去十年左右多個機構(gòu)之間的一次大型合作。該領(lǐng)域的乳腺科醫(yī)生收集了樣本，然后存檔于各地的自然歷史博物館，即UNM西南生物博物館，波特蘭州立大學(xué)自然歷史博物館和北阿拉斯加大學(xué)博物館。

“樣本分布在整個北美西部......大量的實地工作，實驗室工作和計算機工作，”他說。